Novým trenérem se před sezonou stal bývalý hráč Ostroje Petr Ondrášek. V polovině ročníku jej nahradil Oldřich Sedláček, bývalý trenér Vítkovic a Žiliny, jenž působil také v Malajsii. Ostroj se pohyboval v druhé polovině tabulky a nakonec obsadil až 10. místo.

Významná událost nastala v únoru 1993, kdy byl ředitelem klubu zvolen Alois Sommer. Ten zároveň po dubnovém odvolání trenéra Sedláčka dokončil tento ročník na trenérské lavičce. Konečné umístění bylo zklamáním i z toho hlediska, že prvních 6 týmů v tomto ročníku automaticky postupovalo do nově vytvořené první české ligy.

Zatímco v ligové soutěži se Opavě nedařilo, tým zažil nejlepší pohárovou jízdu ve své historii. Postupně přes Uničov, Bohumín, Karvinou a Drnovice se Ostroj probojoval do čtvrtfinále, kde na něj čekaly České Budějovice. Hrdinou zápasu se stal Vilém Axmann, který v penaltovém rozstřelu chytil střelu Karla Poborského a sám proměnil rozhodující kop. Cesta Opavy tak skončila až v semifinále po těsné jednobrankové prohře s Brnem.