Vedení klubu po odchodu Aloise Sommera nezahálelo a přivedlo do Ostroje kvalitní náhradu. Novým trenérem se stal 40letý Petr Žemlík, bývalý trenér Nového Jičína a Frýdku-Místku. Ambiciózní kouč přišel s cílem hrát do 6. místa. Klub do tohoto ročníku vstupoval pod hlavičkou FK Ostroj Opava poté, co se oddělil od tělovýchovné jednoty. Od 1. ledna 1991 začal klub fungovat jako akciová společnost.

Do týmu přišli z vlastních zdrojů Vilém Axmann a Milan Barteska, posilami z jiných týmů byli Daniel Pluschke, Roman Hon a Lumír Havránek. V zimě se z vojny vrátil Radomír Prasek. Petru Žemlíkovi se podařilo zapracovat na zkvalitnění defenzivy týmu. Během jeho prvního angažmá v Opavě zažil klub do té doby nejúspěšnější období. V ročníku 1990/91 se Ostroj umístil na 4. místě v druholigové tabulce, následující rok přišlo ještě další zlepšení.